Atualizada em: 19/03/2012
Sub-rotinas são habilidades especiais adquiridas através da janela Habilidades. Sub-rotinas podem ter resultados diversos, como, por exemplo, aumentar o dano de uma nave por um determinado tempo ou até mesmo tornar a nave invisível a radares. Ao contrário das outras habilidades, as sub-rotinas devem ser ativadas pelo jogador para que tenham efeito.
Há sub-rotinas genéricas (válidas para todos os personagens) e aquelas que variam de acordo com a carreira escolhida pelo personagem.

As sub-rotinas genéricas são:

Cruise Speed - Ativa o modo de cruzeiro, aumentando a velocidade total da nave, enquanto a sub-rotina estiver ativa.
Afterburner - Enquanto ativada, projeta a nave em alta velocidade.
Drifting - Permite à nave girar no próprio eixo, enquanto a sub-rotina estiver ativa.

Cada carreira possui seis sub-rotinas exclusivas:

- Carreira Assalto

Dodge: Aumenta a chance de desviar de mísseis.
Hellfire: Faz com que os disparos de canhão corrompam o escudo do alvo por mais tempo.
Overdrive: Sobrecarrega os canhões, aumentando o dano causado.
Energy Drain: Cada dano causado recupera uma parcela do seu escudo.
Engine Burn: Todos os seus tiros de canhão que acertarem a parte de trás do alvo causam mais dano.
Frontal Shield: Cria uma barreira na frente da nave do jogador, que o acompanha até acabar a sua duração.

- Carreira Vanguarda

Armor Up: Aumenta a resistência do escudo e recarrega uma parcela do refrigerador a cada tiro recebido.
Bravado: Força o radar de naves inimigas a travar em sua nave, além de reduzir o dano recebido dessas naves.
Karma: O escudo da nave se torna uma barreira refletora, devolvendo uma parcela do dano recebido.
Guardian: Lança uma esfera energética sobre o alvo, criando um link entre o alvo (amigo ou inimigo) e o Vanguarda, dividindo o dano entre os dois.
Ionic Void: Enquanto esse modo estiver ativo, a nave recupera uma parcela de seu escudo para cada nave que ela destrói.
Vendetta: Faz um disparo frontal único. Quanto menos escudo o jogador tiver, mais dano causará.

- Carreira Supressor

Dead Weight: Quando ativa, adiciona uma carga de energia aos seus canhões que, ao acertarem um tiro no alvo, reduzem sua velocidade por alguns instantes.
Stealth: Sua nave fica invisível, saindo do radar e da seleção de alvos. Durante esse modo, nenhum canhão funciona.
Grav-Pulse: Causa danos ao escudo e ao refrigerador do alvo.
Coolant Void: Enquanto esse modo estiver ativo, a nave recupera uma parcela de seu refrigerador para cada nave que ela destrói.
Increase Heat: Efetua um disparo que, ao acertar o alvo, reduz a cadência dos tiros do inimigo, aumenta a quantidade de refrigerador necessário por tiro e aumenta o cooldown das sub-rotinas.
Stasis Wall: Ao ativar esta sub-rotina, a nave cria uma barreira energética no espaço, que paralisa todas as naves que colidirem com ela.